Wenn ich richtig verstanden habe was du vorhast, dann hast du dir die Antworten schon selbst gegeben. Blue/Greenscreen (Keying) wäre eine Möglichkeit, Ausschneiden (Rotoscoping) die andere. Beides ist auf seine Art mit ziemlich viel Aufwand verbunden und für akzeptable Ergebnisse kommt man nicht um gute Software herum.
Nimm am besten "Keying" und "Rotoscoping" mal als Suchwörter hier im Forum und bei den bekannten Suchmaschinen....da solltest viele Infos zum Thema finden

Gruss